生物型原子力顯微鏡應用范圍廣闊，不受外界條件限制，主要可用于以下幾種場景：
 

　　1.材料科學：可應用于材料的形貌、電學、磁學和機械性能的觀測和研究。應用實例：一維ZnO納米陣列、納米發電機研究。
 

　　2.物理學：可以從納觀物理、介觀物理到微觀物理多個方面探測材料的各種物理特性。應用實例：物質內部載流了注入過程、能量散射過程研究。
 

　　3.化學：可控環境下化學反應的原位探測工具，在原子級水平上研究表面化學反應及其變化。應用實例：可控超分子科學研究。
 

　　4.生物學：生物型原子力顯微鏡廣泛應用于DNA、RNA、蛋白質、細胞的運動和形態、細胞膜與病毒相互作用中的原位高分辨率液態成像，蛋白質/細胞間相互作用力、蛋白質折疊分子力、生物大分子對細胞表面抗原和細胞內反應分子力測試，可切割DNA、微管以及其他小纖維并進行表面處理。應用實例：DNA分子力測試以及蜘蛛絲蛋白分子的彈性系數測量。
 

　　5.微電子：大規模集成電路(lC)檢測、lC的局域電特性研究、超高密度光/磁信息存儲和讀取的研究。應用實例：半導體超高分辨掃描電容顯微技術。
 

　　6.醫學：生物細胞介觀和納觀研究有力工具、結合生物倒置顯微鏡、螢光顯微鏡、全反射內置熒光顯微鏡、熒光能量共振轉移顯微鏡以及共聚焦顯微鏡、廣泛應用于藥物、藥理、免疫、診斷及治療等學科。應用實例：HIV病毒與細胞互相作用力研究。
 

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